Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNG6Q9BXT2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms