Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRIP1Q9BX63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms