Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAIPQ9BWF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms