Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC94Q9BW85 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC94Q9BW85 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms