Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP58Q9BVL2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP58Q9BVL2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms