Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MXRA8Q9BRK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MXRA8Q9BRK3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms