Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FYCO1Q9BQS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms