Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms