Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TREX2Q9BQ50 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms