Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD9AQ99638 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD9AQ99638 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms