Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3CQ99613 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms