Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD1Q99460 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms