Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARXQ96QS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms