Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNAQ96QF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms