Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGLYRP2Q96PD5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms