Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD11Q96NU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD11Q96NU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms