Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM47Q96LD4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms