Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPNS2Q96L46 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPNS2Q96L46 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms