Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms