Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms