Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRIQ1Q96JM4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
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