Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG3Q96JB2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms