Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRIG1Q96JA1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms