Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHDQ96IW2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms