Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALML4Q96GE6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALML4Q96GE6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms