Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC10A4Q96EP9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC10A4Q96EP9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms