Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EAF2Q96CJ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EAF2Q96CJ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms