Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIFAQ96CG3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TIFAQ96CG3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms