Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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