Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP9XQ93008 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP9XQ93008 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP9XQ93008 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms