Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP13Q92995 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP13Q92995 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP13Q92995 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP13Q92995 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP13Q92995 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP13Q92995 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP13Q92995 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP13Q92995 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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