Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF4BQ92750 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms