Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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PTPRUQ92729 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
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PTPRUQ92729 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
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PTPRUQ92729 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
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PTPRUQ92729 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
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PTPRUQ92729 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRUQ92729 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
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