Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASKIN2Q8WXE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms