Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWA1

TMEM40, Transmembrane protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM40Q8WWA1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM40Q8WWA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms