Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC12Q8WUD4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC12Q8WUD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.3 ms