Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TSKUQ8WUA8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSKUQ8WUA8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms