Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCOLN3Q8TDD5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN3Q8TDD5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms