Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX54Q8TDD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms