Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms