Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA4Q8NEY3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms