Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPC24Q8NBT2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPC24Q8NBT2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms