Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNLDC1Q8NA58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNLDC1Q8NA58 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms