Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC4Q8N9L1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms