Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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DTX3Q8N9I9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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