Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRBD1Q8N5C6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRBD1Q8N5C6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms