Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHTF2Q8N3S3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHTF2Q8N3S3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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