Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC117Q8IWD4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC117Q8IWD4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms