Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYFIP1Q7L576 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP1Q7L576 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms