Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC8DQ7L1W4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8DQ7L1W4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms